Sankt Annæ Gymnasium har store traditioner, hvad angår musik og sang. Sankt Annæ Gymnasium huser 3 kor: Københavns Drengekor, Sankt Annæ Pigekor og Sankt Annæ Gymnasiekor. På gymnasiet er der etableret et Musikalsk Grund-Kursus (MGK), som er kombineret med et 4-år langt gymnasieforløb. Se mere på Sankt Annæ Gymnasiums hjemmeside. I Koncertsalen afholdes arrangementer